In der Geschichte der Staatsbibliothek  ist es mit wachsender Größe ihrer Bestände immer wieder zur Separierung von Sondermaterialien bzw. bestimmten Bestandsgruppen gekommen. Das gilt auch für Teile des allgemeinen Druckschriftenbestandes, die insbesondere aufgrund ihres Wertes und ihrer Seltenheit nach und nach gesondert aufgestellt wurden. Hinzu kamen Gelehrten- und Bibliophilenbibliotheken, die in Hinblick auf ihre Bedeutung in der Staatsbibliothek als geschlossene Provenienz erhalten bleiben sollen. 
Diese Sondersammlungen gehören zu den großen Kostbarkeiten der Bibliothek. Sie werden unter besonderen konservatorischen Bedingungen aufbewahrt und werden nur im Rara-Lesesaal für die Benutzung bereitgestellt. 

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• Die Aldinen PDF-Version
• Archiv der Deckerschen Geheimen Ober-Hofbuchdruckerei PDF-Version
• Bibliothek deutscher Privat- und Manuskriptdrucke (BdPM)
• Bibliothek Diez PDF-Version
• Bibliothek Kaiser PDF-Version
• Bibliothek Savigny PDF-Version
• Bibliothek Sofia Albertina von Schweden
• Bibliothek Varnhagen PDF-Version

Einbandsammlung PDF-Version
Einblattdrucke und Flugblätter PDF-Version
Einblattdrucke und Flugblätter | 16. Jahrhundert PDF-Version
Einblattdrucke und Flugblätter | Erster Weltkrieg PDF-Version
Einblattdrucke und Flugblätter | Kalter Krieg PDF-Version
Einblattdrucke und Flugblätter | Pazifikkrieg (1941–1945) PDF-Version
Einblattdrucke und Flugblätter | Zweiter Weltkrieg PDF-Version
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Historische Flugschriften PDF-Version

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Rara-Sammlung PDF-Version
Russische Künstlerbücher PDF-Version

Sammlung 16. Jahrhundert  PDF-Version
Sammlung Brandenburger Schöppenstuhl
Sammlung Lynar PDF-Version
Theaterzettel PDF-Version 

Weltliche und geistliche Lieder aus der Bibliothek Meusebach PDF-Version