Die Sammlung der Handschriften aus Südostasien ist geprägt durch die Vielzahl von Sprachen, die sich in ihr wiederfinden. Allein die bedeutende Sammlung von Carl Schoemann (272 Bände), die dieser in den Jahren 1845 bis 1851 zusammengestellt hat, umfasst 12 Sprachgruppen. Die Bibliothek tätigte über die Jahre eine Vielzahl von Einzelerwerbungen, aber auch größere Bestandseinheiten konnten angeschafft werden, etwa eine umfangreiche Sammlung burmesischer Handschriften in den Jahren 1969-1971.